1.病原学检查

　　(1)培养及涂片：约10%～20%正常人的痰液也可查得此菌。必须区别是寄生菌抑或为致病菌。

　　肺白色念珠菌病：

　　在侵入黏膜致病可形成假菌丝，故痰直接涂片发现念珠菌孢子及假菌丝则有助于诊断。

　　以沙保葡萄糖琼脂培养基作痰念珠菌分离培养，于37℃温箱或室温下培养3～5天，可见乳白色湿润光泽圆或卵圆形菌落，具特殊酵母香味，如菌落数目超过50%则有诊断意义。当移种在玉蜀黍培养基上时，则可见到分枝状菌丝及厚膜孢子等本菌的特征。

　　肺隐球菌病：

　　按标准方法留取痰或脑脊液，经离心沉淀后置于玻片上，加1滴细墨汁染色，覆盖盖玻片，在显微镜下可以找到直径4～20μm的圆形厚壁孢子，内有大小不等的反光颗粒，外有宽阔折光的荚膜。有时可见出芽现象。50%隐球菌脑膜炎患者脑脊液中可用墨汁染色检出隐球菌。

　　在葡萄糖琼脂培养基上，37℃或室温下孵育可得乳黄色或褐黄色菌落。动物实验证实隐球菌对小白鼠致病。痰或支气管分泌物中找到隐球菌，结合临床可作出肺隐球菌病的诊断。

　　肺曲霉菌病：

　　取痰液的标本作直接涂片或培养，涂片可见菌丝或曲霉菌孢子。

　　分离培养一般选择萨布罗培养基。培养见曲霉菌生长。曲霉菌是实验室常见的污染菌，必须反复涂片或培养，多次阳性且为同一菌种才有诊断价值。

　　肺毛霉菌病：

　　标本来自上鼻甲刮片、鼻窦吸出物、痰液及活检标本等，用20%氢氧化钾制成湿片直接镜检，可见典型的厚壁具折光性的菌丝，直径6～15μm，亦可见膨大细胞及弯曲菌丝。孢囊梗直接由菌丝长出，菌丝可分支，呈直角。

　　将临床标本接种于不含放线菌酮的麦芽糖培养基、马铃薯培养基及普通沙氏培养基中，37℃或25℃培养，生长较快，初起菌落表面呈棉花样、白色，渐变为灰褐色或其他颜色。肺毛霉病发病凶险，而毛霉又常污染痰及环境，故直接镜检往往较培养更有意义。

　　(2)血培养：特别是在免疫功能低下的患者，血培养多次获得真菌者有助于播散型隐球菌病的诊断。一般血培养较少获得阳性，如为阳性则提示为严重感染。对身体浅表部位发生白色念珠菌感染或念珠菌肠炎者，应早期、反复送检血培养。培养时间不应少于4周。阳性结果有诊断价值。

　　(3)肺活检：亦有助于确诊。遇危重病例肺部有大块融合病变者，可作肺穿刺，取肺穿刺液作培养及直接涂片，发现病原菌有确诊意义。采用合适的染色方法是提高诊断率的关键。常用的染色方法有嗜银染色法、Gridly染色法、姬姆萨氏染色法、革兰氏染色法、苏木素-伊红(H-E)染色法和过碘酸雪夫氏(PAS) 染色法。

　　(4)皮试和动物试验：真菌抗原皮肤试验血清学检查、动物接种等可协助诊断。

　　(5)PCR检测：PCR检测真菌高度保守特异性rDNA片段的敏感性比乳甘露糖测定及乳胶凝集试验都高。另外，有人将发光剂Calcofluor white，Blankophor和IJvitex等二苯乙烯类化合物用于体液、组织切片、涂片及皮屑毛发进行真菌染色，使标本在紫外线下发出蓝白或黄白色的光，能够提高镜检的敏感性，提高检出率(达95%)。采用该实验检查假阳性率偏高。但随着近年来分子生物学技术的提高，日后会有越来越多的分子生物学技术应用于临床，如生物芯片技术，会进一步提高临床诊断率和缩短检查周期。

　　(6)X线检查

　　肺白色念珠菌病：有点状阴影，可似粟粒性结核，并有大片实变灶，少数有胸腔积液及心包积液，肺部病变主要分布在中、下野，尤以下部为多，一般不侵犯肺尖。少数患儿可并发渗出性胸膜炎。阴影在短期内变化很大，一处肺野阴影减退，另一处阴影又可增多。急性血行播散性炎真菌性时，X线检查可见粟粒状阴影、弥散性结节状阴影或多发性小脓肿。

　　肺隐球菌病：X线表现为多形性，轻者仅表现为双肺下部纹理增加或孤立的结节状阴影，偶有空洞形成。急性间质性炎症可表现为弥漫性浸润或粟粒样病灶。

　　肺曲霉菌病：曲霉菌支气管肺炎：肺纹理增多，肺部可见弥漫性斑片状模糊阴影、团块状阴影。球型肺曲霉菌病：可见圆形曲霉球悬在空洞内，形成一个新月体透亮区，有重要诊断价值。

　　肺毛霉菌病：大多呈迅速进展的大片肺实变阴影，可形成空洞，或为肺梗塞阴影。少数呈小结节状阴影。