主要的鉴别要点为是否有结缔组织附着丧失和牙槽骨吸收。患牙龈炎时，一般不累及深部组织。若不予治疗，牙周组织继续破坏到深部组织，则形成了牙周炎。除临床检查外，X线（尤其牙合翼片）有助于判断早期牙槽骨吸收。
牙龈炎一般无自发性出血，这需要与血液病及其他疾病引起的牙龈出血鉴别。相关的血液学检查有助于排除血液系统疾病。
除了牙龈自发性出血，龈乳头和龈缘的坏死外，疼痛明显是坏死性溃疡性龈炎的特征性表现，而牙龈炎通常没有自发痛。
人类免疫缺陷病毒（HIV）感染者早期出现，可见游离龈缘呈明显的火红色线状充血带，即牙龈线性红斑，而且去除局部刺激因素（如菌斑）后，牙龈充血仍不消退。
