高碳酸血症需要和下面的症状相互鉴别：
低氧血症：是指血液中含氧不足,主要表现为血氧分压与血氧饱和度下降,低氧血症是呼吸科常见危重症之一,也是呼吸衰竭的重要临床表现之一。因为低氧血症是指动脉血氧水平低于正常是外呼吸障碍的结果。
缺氧症：为细胞利用氧量不足而呈现的脏器组织功能异常是内呼吸障碍的结果。
高碳酸血症期间无低氧血症。虽然PaCO2较高pH值较低，但临床上仅有暂时的神经系统抑制,表现为反应迟钝或昏迷。
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