本病呈急性起病，以发热、腹痛、腹泻、里急后重及黏液脓血便为特征，粪便中有大量红细胞、白细胞，并有脓细胞。培养有痢疾杆菌生长可以鉴别。
有不洁食物进食史，同食者常同时或先后发病，潜伏期较短，多为数小时。剩余食物、呕吐物或排泄物培养可有致病菌生长可以鉴别。
有疫水接触史。急性血吸虫病有发热、尾蚴皮炎、腹痛、肝大，每天排便10次以下，粪便稀薄。血中白细胞总数及嗜酸性粒细胞显著增多。血吸虫抗原或抗体检测阳性可以鉴别。
长期低热、盗汗、消瘦，带黏液而少脓血，腹泻与便秘交替，大多数患者有原发结核灶存在。
直肠癌常有腹泻，每天排便次数多，每次量少，带黏液、血液，肛门指检有助于鉴别。左侧结肠癌常有排便习惯改变，粪便变细。右侧结肠癌有不规则发热，进行性贫血、排便不畅，晚期可触及包块。结肠镜检查有助于诊断。
临床表现相似，但粪便多次病原学检查阴性，血清阿米巴抗体阴性，病原治疗无效时考虑本病，结肠镜有助于诊断。
