鼻窦炎患者的炎性脓涕向后流入咽部，可引起咽和扁桃体炎症。若致病菌直接蔓延，或经过淋巴循环侵入下呼吸道，可引起喉炎、气管炎和支气管炎，免疫功能低下者还可引起肺炎。
鼻窦炎症还可引起的眶内和颅内并发症比较少见，但后果比较严重。
感染鼻窦的细菌和脓液进入眼眶内，鼻窦外伤或手术损伤相邻眼眶壁，这些都有可能引发眼部并发症，导致视力下降甚至失明。常见的有眶周蜂窝织炎、眶骨膜下脓肿、眶内蜂窝织炎、眶内脓肿、球后视神经炎等并发症。
该并发症较少，主要有硬膜外脓肿、化脓性脑膜炎、脑脓肿及海绵窦血栓性静脉炎等并发症。
