直肠中下段的息肉可通过直肠指检触及，不能触及的结直肠息肉通过肠镜检查可确认。小肠息肉往往在出现并发症或手术中才能发现。
医生发现患者存在肠息肉后，通常需要取一些息肉组织进行活检，通过显微镜或者化学方法分析得出息肉的具体类型、性质。
多数息肉患者长期隐性失血，大便隐血试验阳性。
包括结肠镜、直肠镜和纤维结肠镜，为该疾病的主要检查和复查手段，可直接观察到息肉的位置、大小、形态，对于可疑恶性的息肉，可于镜下取活检，进一步明确病理诊断。
对于直肠区域病变的诊断是必要的。
钡灌肠是指从肛门插进一个肛管、灌入钡剂再通过X线检查，可诊断结肠及以下部位的肿瘤、息肉、炎症、结核、肠梗阻等病变。有肠镜禁忌证或肠镜不能耐受的患者用此方法。
