多发性硬化症的治疗主要包括急性期和缓解期治疗，此外还有对症治疗。
急性期的治疗目标是减轻恶化期症状、缩短病程、改善残疾程度和防治并发症。多发性硬化症为终身疾病，其缓解期治疗目标是控制疾病进展。
糖皮质激素为急性期治疗的一线药物，激素治疗能促进急性发病患者的神经功能恢复，治疗原则是大剂量，短疗程。
缓解期治疗即疾病修饰治疗（DMTs）和对症治疗，主要为药物治疗。
常用治疗药物包括β-干扰素、特立氟胺、西尼莫德、芬戈莫德、奥法妥木单抗、那他珠单抗、米托蒽醌等。
包括IFN-β1a和IFN-β1b两种重组制剂，可抑制T淋巴细胞的激活，减少炎性细胞穿透血脑屏障进入中枢神经系统。
IFN-β1a有两种规格，22μg和44μg。通常均需持续用药2年以上，因多发性硬化症患者使用干扰素-β治疗后，能产生中和抗体，因此用药3年后临床疗效下降。
常见不良反应为疲倦、寒战发热、肌肉疼痛、出汗等流感样症状，及注射部位红肿、疼痛等。采用逐渐增量的方法可减少流感样症状的发生，睡前注射或注射前服用非甾体类抗炎药也可减轻流感样症状。
此外，β-干扰素禁用于妊娠或哺乳期妇女。
特立氟胺适用于已确诊的复发型多发性硬化症患者，可有效降低患者的年复发率。
常见的不良反应为腹泻、呕吐、头发稀疏、丙氨酸氨基转移酶（ALT）水平升高。因此，重度肝损伤患者禁用此药，应用此药前，还应检测患者ALT和胆红素水平。开始治疗后，也应连续检测ALT水平，至少6个月。
另外，特立氟胺具有潜在致畸性，因此孕妇及备孕者需禁用此药。本药主要作用是抑制炎症因子通过血脑屏障，但会增加进行性多灶性白质脑病的发生风险。
西尼莫德可用于治疗成人复发型多发性硬化，包括临床孤立综合征、复发-缓解型疾病和活动性继发进展型疾病；对进展期患者有显著延缓残疾作用，在延缓脑容量损失及改善认知方面也有积极作用。
西尼莫德属于鞘氨醇-1-磷酸（S1P）受体调节剂，可阻止淋巴细胞从淋巴结逸出，减少外周血淋巴细胞的数量。
常见不良反应为头痛、高血压和转氨酶升高等，其他不良反应应咨询医生。
芬戈莫德可用于治疗10岁或10岁以上复发型多发性硬化患者，具有儿童适应证覆盖，能有效减少多发性硬化患者疾病复发。
芬戈莫德其属于鞘氨醇1-磷酸 (S1P) 受体调节剂，可减少复发频率，延缓致残进展速度。
常见不良反应为流感、鼻窦炎、头痛、腹泻、背痛、肝酶升高和咳嗽等，其他不良反应和用药风险应咨询医生。
奥法妥木单抗是一种抗人CD20的全人源免疫球蛋白G1单克隆抗体，通过诱导B细胞溶解达到治疗作用；用于治疗成人复发型多发性硬化的皮下注射药物，其适应证包括临床孤立综合征、复发缓解型多发性硬化和活动性继发进展型多发性硬化。
常见不良反应为上呼吸道感染、注射相关反应（全身性）、头痛和注射部位反应（局部）等，其他不良反应应咨询医生。
那他珠单抗是重组α4-整合素的单克隆抗体，能阻止激活的T细胞通过血脑屏障。
可增加进行性多灶性白质脑病发生的风险，用药须经医生评估。
米托蒽醌能够减少复发缓解型多发性硬化症的发作频率，延缓神经功能障碍的进展。
常见副作用包括胃肠道反应、肝功能异常、血细胞减少等。
醋酸格拉默是一种合成氨基酸聚合物，结构与髓鞘碱性蛋白类似，可通过特定机制发挥抗炎作用。
可能会引起局部红肿、硬结、压痛、发热、瘙痒等局部注射反应。
富马酸二甲酯是一种免疫抑制药物，主要用于治疗复发缓解型多发性硬化。
常见不良反应有恶心、腹泻、腹痛、面部潮红、头痛等。
阿仑单抗是一种靶向CD52细胞溶解单抗，适用于复发缓解型多发性硬化和原发进展型多发性硬化，尤其是对两种或更多药物治疗效果不佳者。
常见不良反应有皮疹、头痛、发热、恶心、泌尿系感染、疲乏、失眠、关节炎等。
奥他丽珠单抗是一种B细胞CD20+抗原抑制剂单克隆抗体，可用于治疗复发缓解型多发性硬化和原发进展型多发性硬化。
不良反应包括皮肤瘙痒、头痛、呼吸道感染等。
硫唑嘌呤对降低年复发率可能有效，但不能延缓残疾进展。
由于硫唑嘌呤具有细胞毒性和免疫抑制作用，长期用药会增加恶性肿瘤发生风险，其应用须经医生充分评估疗效/风险比，用药期间需要严密监测肝功能、肾功能。
环孢素A、甲氨蝶呤、环磷酰胺、克拉屈滨等药物也可用于治疗多发性硬化，具体用药须由医生评估后确定。
多发性硬化症常会引起肢体痉挛、疼痛及疲劳等症状，因此应对症治疗。
可使用抗胆碱药物解除尿道痉挛、改善储尿功能，如索利那新、托特罗定、非索罗定、奥昔布宁等药物。
达方吡啶可改善各种类型的多发性硬化患者的行走能力。
可用选择性5-羟色胺再摄取抑制剂类药物，辅以心理辅导治疗。
可用莫达非尼、金刚烷胺，早晨服用。
目前仍缺乏疗效肯定的治疗方法，可使用胆碱酯酶抑制剂，如多奈哌齐。
如男性患者勃起功能障碍，应使用改善性功能药物，如西地那非治疗。眩晕症状可选择昂司丹琼或东莨菪碱治疗。
