这是一种先天性疾病，与胚胎早期甲状舌管未退化或退化不全有关。
目前，尚不明确具体什么病因可导致甲状舌管发育异常。
甲状舌管是胚胎早期连接甲状腺和舌盲孔之间的狭窄管状结构，通常在胚胎第6周开始萎缩退化，到第8周时甲状舌管可完全消失。但若胚胎期甲状舌管未退化消失或退化不全，残留的部分管状结构因上皮分泌物积聚其中，可形成囊肿。
目前，尚不清楚导致甲状舌管发育异常的病因。虽然大多数病例是散发的，但也有报道称存在家族聚集性发病，可能与基因遗传有关。
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小儿甲状舌骨囊肿症状
甲状舌骨囊肿严重吗
