克罗恩病的病因尚不完全清楚，目前认为是由多因素相互作用所致，主要包括：

• 环境因素；
• 遗传因素；
• 感染与肠道菌群；
• 免疫等因素。

可概括为：

• 环境因素作用于遗传易感者，在肠道菌群参与下，启动肠道异常免疫应答，最终引起免疫损伤和炎症过程，可能因为患者免疫调节紊乱和（或）特异抗原的持续刺激，上述免疫炎症反应表现为过度且难以自限。

克罗恩病的病因有哪些？

环境因素

近年来，克罗恩病的发病率持续增高，可能与社会工业化有关。研究表明，吸烟与克罗恩病发病率呈正相关，除此之外，生活方式改变、高脂饮食等因素，亦可能导致本病发作。

遗传因素

研究发现克罗恩病患者一级亲属发病率显著高于普通人群；克罗恩病发病率单卵双胎显著高于双卵双胎。目前研究认为，克罗恩病既是多基因病，也是遗传异质性疾病（即不同人由不同基因引起），具有遗传易感性的患者在一定的环境因素作用下而发病。

感染与菌群因素

• 近年发现炎症性肠病患者存在肠道菌群失调，认为疾病发生可能是由针对自身存在的肠道菌丛的异常免疫反应所致。
• 抗生素或益生菌制剂治疗对某些患者有效，间接证实了这一病因。

免疫因素

肠道黏膜免疫反应的异常激活是引起克罗恩病肠道炎症发生、发展和转归的直接原因。

近年被广泛接受的学说认为，患者存在“免疫耐受"缺失，所以对正常肠道抗原（食物或微生物）发生异常免疫反应。正常情况下，肠道黏膜固有层也存在低度慢性炎症，克罗恩病患者由于免疫调节障碍，对某些食物及药物产生异常免疫应答反应。