脑干损伤危及生命，在救治时要积极处治合并伤及并发症，救治措施具有综合性，包括急救药物、急诊手术及其他抢救治疗。针对不同类型患者有所侧重，对危及生命的损伤优先处理，迅速阻断恶性循环，争取在脑干损伤不可逆之前使患者有所好转。
遏制和减轻脑干水肿，可用小剂量的甘露醇，大剂量的激素、呋塞米及胞二磷胆碱，在脑干损伤后1小时内给药效果最好。
患者昏迷持续，且有呼吸困难、呼吸道分泌物增多的症状，应立即行气管切开术，在脑干损伤后12小时内为宜。
脑干损伤合并颅内血肿时，应清除血肿或行内外减压手术，争取在继发性脑干损伤前解除脑部受压，紧急情况下可钻孔引流以缓解高颅压。
脑干损伤合并其他部位损伤时，应优先处理危及生命的合并症，如肝脾破裂、胃肠道出血等。
积极防治颅内外并发症，如肺炎、泌尿系感染、颅内感染等。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
由异丙嗪、氯丙嗪、哌替啶组成，可以镇痛，镇静，降低体温，降低机体代谢速率，使机体平稳度过缺氧、缺乏能量的时期，争取更多治疗时间。
如甘露醇、糖皮质激素等，可以增加尿量、减轻水肿、降低颅压，维持神经细胞膜稳定。
如醒脑静、奥拉西坦、神经营养因子，神经苷脂，以及中药等，可促进受损神经生长，有利于功能恢复。
为防止并发症，可预防性使用一些抗生素及抗应激反应药物。
脑干损伤患者容易出现呼吸紊乱甚至呼吸衰竭，应及时行气管插管或气管切开术，能保持气道通畅，有效减轻或预防呼吸紊乱对机体造成的影响。
脑干损伤出血后患者容易出现脑积水，导致颅内压升高，可通过引流来降低颅内压，改善脑干受压情况，有利于脑干功能恢复。
适用于颅骨骨折导致脑干损伤的患者，可通过修补颅骨解决脑供血、脑脊液循环不足或障碍等反常性问题，以保护脑干，避免二次损伤。
适用于颅内血肿引起中线结构移位和初期脑疝、压迫脑干的患者，可以开颅手术进行直视下的血肿清除，阻断继续出血并解除压迫。
继发性脑干损伤由颅内肿瘤压迫所致的患者，可切除压迫脑干或导致脑移位、脑疝的肿瘤，目的在于缩短脑干受压时间，增强脑干功能恢复。
