由于AS是一种慢性、系统性、全身炎症反应性疾病，除累及脊柱和外周关节外，还可累及关节外其他器官，如眼、心脏、肺、肾等而出现相应的并发症。
眼部病变是最常见的关节外表现，以急性前葡萄膜炎和急性虹膜炎多见，也可发生急性结膜炎。
AS患者的肾脏损害，主要表现为肾淀粉样变性和IgA肾病。
AS患者可能出现升主动脉根和主动脉瓣病变，以及心传导系统异常。
胃肠道症状与疾病本身的胃肠道炎症、黏膜免疫有关，也可能与NSAIDs的不良反应有关，主要有食欲缺乏，恶心呕吐，腹泻，便血和腹痛等症状。
少数患者后期可并发上肺叶斑点状不规则的纤维化病变，表现为咳痰、气喘、甚至咯血，并可能伴有反复发作的肺炎或胸膜炎。
