主要与后天性心脏病（如冠心病）进行鉴别。先天性心脏病主要表现是起病年龄小，且越小发生几率越大，有特殊杂音。通过超声心动图，了解心脏解剖结构和生理活动，即可诊断。
常见的后天性心脏病有冠心病、风心病、肺心病等，简单介绍与其他心脏病的鉴别。
应与急腹症、心脏神经官能症、植物神经功能失调、急性肺动脉栓塞、胆管和上消化道病变相鉴别。行冠状动脉造影能观察到冠脉血流不畅，是冠心病与其他疾病的鉴别要点。
应与感染性心内膜炎、病毒性心肌炎、类风湿性关节炎、结缔组织病等相鉴别。风心病的血清中有抗A型链球菌抗体。
需与缺血性心衰、高血压性心脏病、甲亢性心脏病等相鉴别。肺心病有呼吸道病史且经X射线可见肺部病变，血气分析可见低氧血症。
