先兆流产是发展为自然流产的一个阶段，病因包括胚胎因素、母体因素、父亲因素和环境因素。
胚胎染色体异常是早期流产最常见的原因，约占 50%~60%。
孕妇患全身性疾病，如严重感染、高热疾病、严重贫血或心力衰竭、血栓性疾病、慢性消耗性疾病、慢性肝肾疾病或高血压等，均可能导致流产。
TORCH感染（弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、单纯疱疹病毒）虽对孕妇本身的影响不大，但可感染胎儿而导致流产、死胎、早产和先天畸形等。
子宫畸形（如子宫发育不良、双子宫、双角子宫、单角子宫、纵隔子宫等）、子宫肌瘤（如黏膜下肌瘤及某些肌壁间肌瘤）、子宫腺肌病、宫腔粘连等，可影响胚胎着床发育从而导致流产。
宫颈重度裂伤、宫颈部分或全部切除术后、宫颈内口松弛等所致的宫颈机能不全，可导致胎膜早破而发生晚期流产。
如女性内分泌功能异常（如黄体功能不全、高催乳素血症、多囊卵巢综合征等）、甲状腺功能减退、糖尿病血糖控制不良等。
妊娠期严重的躯体刺激（如手术、直接撞击腹部、性交过频）或心理的不良刺激（过度紧张、焦虑、恐惧、忧伤等精神创伤），均可导致流产。
孕妇过量吸烟、酗酒、过量饮咖啡、二醋吗啡（海洛因）等毒品，可导致流产。
如孕妇抗磷脂抗体、狼疮抗凝血因子阳性（如患有抗磷脂综合征、系统性红斑狼疮）。
有研究证实精子的染色体异常可导致自然流产。但临床上精子畸形率异常增高是否与自然流产有关，尚无明确的证据。
过多接触放射线和砷、铅、甲醛、苯、氯丁二烯、氧化乙烯等化学物质，均可能引起流产。
以下因素可增加先兆流产的发病风险。
年龄超过35岁的女性，其流产的风险高于年轻女性，且年龄越大，流产风险越高。
连续两次或多次流产的妇女，再次妊娠发生流产的风险较高。
体重过轻或超重均可使流产的风险增加。
