外科手术是治疗隐睾的金标准。所有男孩出生后均应检查睾丸发育情况，并记录下来。对确诊为隐睾患儿的治疗应在出生后6～12个月，最晚不宜超过18月龄。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
主要成分是黄体生成素，直接刺激间质细胞分泌睾酮，使睾丸局部血流加快，促使睾丸增大，精索增粗，阴囊扩大，改善手术条件。
刺激垂体释放卵泡刺激素或黄体生成素，进而刺激间质细胞释放睾酮，促进睾丸下降。可采用鼻黏膜喷雾的给药方式。
有报道指出，激素治疗的推荐用量在不同方案中的差异大，成功率不确切，用药后隐睾成功降至阴囊的患儿，约20%会再次出现睾丸回缩。此外，激素治疗还可能引起皮肤色素沉着、毛发生长和性早熟等内分泌紊乱，因此，其实际价值和科学性尚有待进一步的重新认识。
指通过手术游离足够长的精索，并将睾丸固定于同侧阴囊内。
当隐睾位置较高时，因精索长度不够而无法将睾丸放入阴囊时，选择该手术，主要分两期进行：
对于高位隐睾、精索长度不够时，可通过术中使用无损伤钳暂时阻断睾丸动脉，再用尖刀放射状切开睾丸白膜，如果此时睾丸表面的出血仍呈鲜红色，说明来自输精管动脉等侧支血管的供血较为充足，可高位切断精索血管，利用睾丸侧支血管通路将高位隐睾一次性地下降固定于阴囊内。
反之，若此时睾丸白膜切口的出血呈暗红色的静脉血，则提示睾丸侧支血管通路供血不足，应行分期睾丸下降固定术。
较少用，主要包括睾丸组织移植、吻合血管的睾丸移植和睾丸间质细胞移植。适用于标准睾丸固定术、分期睾丸固定术治疗效果不佳的高位隐睾患者。
在睾丸切除术后，进行一次性或分次睾丸假体植入或异体睾丸移植术，来恢复阴囊的外观，从而减少对儿童心理的影响而健康成长。适用于睾丸严重发育不良，或可疑恶变者，或行睾丸固定术，或睾丸移植术后睾丸萎缩坏死的高位隐睾患者。
与传统的开放手术相比，腹腔镜手术能更精细地游离精索，有利于保护血供和输精管。该手术不仅可以对隐睾进行定位和评估，并且还能进行腹内型隐睾固定或切除术。主要适用于体检时不能触及的隐睾患者，以明确体内是否存在睾丸和睾丸在体内的准确定位。
该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物可缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
