疱疹性皮炎较易诊断，但仍需与特应性皮炎、大疱性表皮松解症，线状IgA大疱性皮病进行鉴别。
特应性皮炎也有红斑、丘疹伴随剧烈瘙痒等症状，因此需与疱疹样皮炎鉴别，但特应性皮炎屈侧皮肤受累常见，水疱较少，苔藓样变及干燥常见，血清IgE通常升高，病理为皮炎、湿疹特点，无谷胶食物服用加重史。
皮肤多发紧张性大疱，类似疱疹样皮炎，但糜烂面多见，口腔、阴道黏膜多累及，病理可见表皮下水疱，线状IgG沉积在基底膜带。
多发环状、群集的丘疹、水疱、大疱，可有口腔糜烂、溃疡，病理表现为表皮下水疱伴有中性粒细胞浸润，应予以鉴别，但免疫荧光提示线状IgA沉积在基底膜带，且无谷胶食物过敏史。
