医生对患者进行体格检查，如：
测量体温、呼吸频率、脉搏和血压，判断患者是否有发热和脉搏微弱、呼吸急促、低血压等，检查患者腹部是否有腹部膨隆、压痛，并通过腹部听诊来判断患者肠道蠕动情况，以及初步判断患者病情轻重。
包括粪便常规、粪便培养和隐血检查，可用于检测致病菌，判断患者是否感染和胃肠道出血。
若粪便艰难梭菌培养及毒素检测结果为阳性，可以诊断此病，但若结果为阴性，不能排除伪膜性肠炎的诊断。
主要用于检测患者是否有感染，或因血便引起贫血等，严重感染者白细胞会升高。
可用于判断患者病情轻重。病情加重时，PCT值可大于0.2ng/ml。
可用于检测患者肾功能情况。因为腹泻而脱水过快或合并脓毒血症时，患者肾功能会受影响。
腹部X线检查，可显示是否有肠梗阻、腹水、结节状结肠增厚、中毒性巨结肠和肠穿孔等情况。
腹部X线检查特异性和敏感度低的患者，推荐CT检查，有助于重症感染和爆发型伪膜性肠炎患者的诊断。
内镜下可见结肠黏膜充血、水肿、斑片状灰绿色或黄褐色伪膜，有经验者可以直接确诊。
