治疗可分为非手术和手术治疗两种方法，但大多数病例需采用以手术为主的综合治疗。
抗菌治疗是治疗原发性腹膜炎的主要措施。
腹腔穿刺放液、灌洗和注射抗生素被认为是治疗肝硬化腹水合并原发性腹膜炎的有效方法。
选择肠道不吸收或仅少量吸收的抗生素，降低胃肠道革兰阴性菌的浓度，对革兰阳性菌和厌氧菌无影响，通常选用诺氟沙星。
另外，应用普萘洛尔和西沙必利等药物，也能有效降低细菌的过度繁殖和易位。
一般2~3种抗生素联合使用。
常用方案有莫西沙星，厄他培南，氟喹诺酮类或第二三代头孢菌素联合硝基咪唑类药物等。严重感染可选用亚胺培南或美罗培安。
在以厌氧菌为主的感染性疾病中，施加高压氧疗，可提高机体抵抗力，促进疾病恢复。
高压氧疗可抑制并杀灭产气荚膜杆菌，减少其毒素的生成。
用于感染伴有腹胀的患者。
在发病期间，患者通常出现有效血容量不足、脱水、电解质紊乱、代谢性酸中毒。由于食欲下降，机体的自身消耗及病变本身，均可导致血浆蛋白下降，甚至贫血。应注意水电解质酸碱平衡。补充热量和营养。
随着炎症过程氧耗不断增加，可出现低氧血症和呼吸性碱中毒。当患者疲劳后，将逐渐形成代谢性和呼吸性酸中毒，而出现生命危险。
因此维持氧分压在10.64~13.3kPa（80~100mmHg），保持酸碱平衡是很重要的。治疗期间应予吸氧，监测血气分析。
继发性腹膜炎绝大多数情况下需要手术治疗，以去除病灶、修补穿孔、消除异物和脓液等，尤其年老或伴有内科疾病者，不宜拖延手术时机。
手术适应症如下：
切口和麻醉的选择依原发病灶部位而定。病因未确定者，可先做剖腹探查。
手术应包括以下几种方法：
该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物在围手术期有可能缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
