积极治疗尿道及周围感染，以恢复尿道排尿功能为目的，恢复尿道的解剖连续性和完整性。还应避免在治疗过程中出现新的并发症。
推荐行尿道扩张或尿道外口切开术作为初始治疗。复发性尿道口或舟状窝狭窄患者，推荐行尿道成形术。
阴茎段尿道狭窄经内镜下治疗后，复发率高，推荐该类患者接受尿道成形术。
阴茎段尿道成形术，可选用：
阴茎皮肤薄而活动，疏松的浅筋膜允许阴茎皮瓣转移到阴茎段尿道的任何部位，其是阴茎段尿道狭窄较理想的重建材料。阴茎带蒂皮瓣治疗尿道狭窄手术成功的关键是将供应阴茎包皮皮肤的两层血管分离，手术要既能保证包皮内板的血运，又可避免阴茎皮肤、包皮内板的坏死。
口腔黏膜作为尿道替代物术式，被广泛应用于尿道疾病。临床上使用的口腔黏膜主要有舌黏膜、颊黏膜、唇黏膜。口腔黏膜用于重建尿道，主要因为其上皮层较其他组织厚、组织致密，应用它来重建尿道后，抗感染和抗创伤能力较其他移植物强。但口腔黏膜材源有限，很难用于修复复杂性超长段尿道狭窄。
游离口腔黏膜尿道成形，是治疗前尿道狭窄或闭锁较为常用的术式，手术成功的关键是游离黏膜必须成活，因此，移植物能否尽快建立新的血液循环和伤口有无感染至关重要。
因此，医生会在术中尽可能做到切除所有尿道床的瘢痕组织，并建立一个能够提供良好血供的接受床，以尽量缩短移植物的缺血时间，使局部无感染，将黏膜条间断固定在阴茎海绵体上消除死腔。
适用于阴茎段尿道重度狭窄。
医生通常以口腔黏膜条覆盖在缺损尿道的背侧，间断缝合固定，重建尿道床，再将阴茎皮瓣与重建的尿道床做侧侧缝合，将远近两端分别与正常尿道黏膜吻合，重建新尿道。
阴囊皮肤邻近尿道，阴囊中隔带蒂皮瓣具有取材方便、皮源充足等优点。但由于阴囊皮肤的伸缩性大、有毛囊等特点，使其尿道成形后易出现毛发生长、形成尿道憩室和结石引起感染，因此临床较为少用，医生仅在其他代替物缺乏的情况下考虑使用。
狭窄长度<2cm的球部尿道狭窄，可将尿道扩张、尿道内切开术、或尿道成形术，作为初始治疗手段。
对于尿道扩张、或直视下尿道内切开术治疗失败的球部尿道狭窄患者，应行尿道成形术而不是反复的内镜治疗。对于狭窄长度≥2cm的球部尿道狭窄，尿道内切开术或尿道扩张治疗成功率低，故推荐尿道成形术为此类患者的初始治疗方案。
治疗球部尿道狭窄的尿道成形术术式有多种，手术方式的选择主要依据狭窄段的长度。
尿道扩大成形术是介于尿道端端吻合和尿道替代成形之间的一种术式，较适于较长段并且瘢痕化较轻的球部尿道狭窄的治疗。此外，尿道端端吻合术也可治疗球部尿道狭窄，该术式使尿道海绵体的血供得以保留，且更有利于保护尿道患者的性功能。
尿道扩张可作为初诊时暂时缓解症状的治疗手段，可有部分疗效，但由于该治疗未去除膀胱颈部纤维增生瘢痕组织，因此，其并不能阻止疾病的进程。膀胱颈部电切或内切开等内镜手术治疗，是治疗膀胱颈部挛缩的首选。
医生在内镜手术的同时，还会考虑局部注射类固醇激素或丝裂霉素C等药物。医生对于反复内镜治疗失败（≥2次）的患者，会考虑开放重建手术。
少数硬化性苔藓样变可能发展为鳞状细胞癌，因此，医生对阴茎硬化性苔藓样变造成的尿道狭窄，必要时需活检，且不应使用生殖器皮肤进行尿道重建。
除尿道成形术外，会阴区尿道造口也可以作为一些尿道狭窄患者长期的选择。
对于严重的阴茎硬化性苔藓样变、多次尿道成形术失败、反复尿道下裂修补失败、会阴区或盆腔放疗的患者，会阴区尿道造口可作为尿道成形术外另一种有效改善患者生活质量的方法。
该疾病的中医治疗暂无循证医学证据支持，但一些中医治疗方法或药物可缓解症状，建议到正规医疗机构，在医师指导下治疗。
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