是由多种因素造成的复杂的临床综合现象，先天因素、后天损伤，以及男性的附睾、输精管、精囊、前列腺等生殖道或生殖腺体发生的急慢性炎症和不良生活习惯等，都会降低精子的运动能力。
造成男性弱精症的病因大致分为以下几类。
染色体异常，常染色体和性染色体畸变除影响精子数目外，还影响到精子的活率和前向运动能力，如XYY综合征、Y染色体缺如、睾丸发育异常、隐睾等。如纤毛不动综合征，一种先天性纤毛结构缺乏，表现为体内的各纤毛细胞的纤毛不能运动，主要是外周微管的纤毛动力蛋白臂缺如。有这一综合征的患者除了精子不能运动外，还可能从病史中追问到慢性呼吸道感染的疾患。
内分泌激素除了对精子的发生和成熟有作用外，还影响精子的运动能力，如促性腺激素合成或分泌功能障碍，包括：Kallmann综合征、腺垂体功能不全、高催乳素血症、甲状腺功能亢进或减退等。
感染对精子活力的影响可以是多方面的，如：腮腺炎病毒引起的睾丸炎，梅毒螺旋体引起的睾丸炎和附睾炎。附睾、输精管、精囊和前列腺等生殖道或生殖腺体的急慢性炎症，引起的精液中白细胞增多，可以通过直接和间接的原因导致精子运动的下降。微生物对精子的直接作用，如支原体可以吸附于精子的头部、中段及尾部，使精子作前向运动时，流体动力学阻力加大，运动速度减慢，影响精子活力及穿透卵细胞的能力。
抗精子抗体(AsAb）可以从几个不同途径影响精子的受精功能，分为由男性产生的抗精子自身免疫和由女性产生的抗精子同种免疫。当发生睾丸炎、附睾炎、前列腺炎等后，精液的免疫耐受机制可能遭到破坏，就可能发生抗精子免疫反应。对精子的活力影响可能是AsAb与精子的尾部结合，精子的活力受到妨碍，运动能力下降，穿透能力也差。
精浆中锌、铜、镁与精液质量有关，精浆锌含量是血浆含量的100倍以上，精子活力低下患者的精浆中锌、铁、镁的含量显著低于活力正常的健康男子。锌可延缓细胞膜的脂质氧化，维持细胞结构的稳定性和通透性，从而确保精子良好活动力。
当男性缺乏维生素E时，引起睾丸损害，性功能减退与紊乱，容易出现精子运动异常或出现精子缺乏。对精子形成障碍患者，给予补充维生素E后，精液中的精子个数、运动性均有所改善，而且维生素E还有预防畸形胎形成的作用。维生素C可以清除体内自由基，防止精子遭受损害。
微量元素镉（Cd）含量高时，可导致精子活动度降低，镉可直接抑制精子的氧化酶及直接抑制精子的运动器官，不育的男子精液中镉含量明显高于生育男子。从事高温、放射职业和接触化学毒物都可引起精子活力降低。
烟草中的尼古丁等通过对精子的直接和间接损伤而影响精子活力，长期嗜酒者可以直接和间接影响精子的运动能力，影响精子活力的药物较多。
还有一些查不出病因的精子活力低下者，称之为特发性弱精症。
