医生全面采集患者病史，根据患者的临床表现及体征可初步判断为痛经，然后结合辅助检查，如内分泌检查、血清CA125测定、B超、核磁、子宫输卵管碘油造影以及宫腔镜检查、腹腔镜检查等排除子宫及盆腔其他器官的器质性疾病，从而明确诊断。
患者均表现为月经前后下腹部疼痛的症状，但继发性痛经多见于生育年龄女性，初潮后数年出现痛经症状，且呈逐渐加重的趋势，严重者使用非甾体抗炎药无效，通常需要与子宫内膜异位症、子宫腺肌病、生殖系统发育异常、盆腔炎性疾病等器质性疾病相鉴别。而功能性痛经患者多为青少年和年轻女性，常在月经初潮后不久发病，经期疼痛程度基本一致，且患者不存在器质性盆腔疾病。
