并发出血时最为严重。囊肿可压迫病灶区附近的血管，导致静脉瘀血或血栓形成，出现区域性门脉高压，此时患者可能合并上消化道出血，引起呕血、黑便等情况。当囊肿侵蚀动脉血管时还可能发生难治的消化道大出血，未及时救治可引起出血性休克。
当破入胃、十二指肠、结肠时，症状可能不明显。如破入腹腔，引发腹膜炎、腹腔内出血和胰性腹水，则可能引起剧烈腹痛、腹膜刺激征、休克等严重后果。部分也可能穿透横膈而形成胰性胸腔积液。
囊肿继发感染是本病最常见的并发症，但后果十分严重，病人病情可能迅速恶化，严重时可能出血脓毒血症，因此需尽快治疗。
假性囊肿过大时，可能压迫周围邻近组织和器官，导致门静脉高压、胃肠道梗阻、胆道梗阻等并发症，患者可能表现为呕血、黑便、腹部绞痛、腹胀、食欲不振、黄疸等症状。
