就诊时医生可能会问如下问题来初步了解患者病情，患者可提前做好回答的准备：
医生会依据病史（患者的诱因、症状及体征），结合血常规和胸部影像学检查在作出诊断。
本病会和肺炎、支气管肺癌、空洞型肺结核、肺囊肿继发感染等疾病有相似之处，医生将从多方面详细检查进行判断。
早期肺脓肿与肺炎在症状和胸部X线表现上很相似。肺炎，特别是细菌性肺炎影像学会有肺实变改变，但较少有空洞或“气液平”改变。痰为铁锈色、无臭味，此外痰或血的细菌培养是重要的检查方法。
当癌性病变发生液化形成“癌性空洞”时，胸部X线表现与肺脓肿较相似。但支气管肺癌多见于40岁以上患者，且一般无畏寒、高热等全身症状，其影像学提示空洞壁厚、内面凹凸不平，部分可伴有淋巴结肿大，病理学检查可显示癌细胞。
慢性期肺脓肿与空洞型肺结核在症状及胸部X线表现上很相似，但空洞型肺结核多见于右肺上叶尖后段和下叶背段，可伴有午后低热、盗汗，以及经痰培养能找到结核杆菌，可进行鉴别。
当囊肿发生感染，液化、坏死后可见“气-液平面”脓腔，与肺脓肿胸部X线表现上很相似。但肺囊肿继发感染无明显畏寒、高热、咳嗽，且通过前后对比胸片可行鉴别。
