必须2次以上独立血培养阳性可诊断此病，观察时间至少2周，是主要确诊标准之一。
红细胞和血红蛋白值均下降，血红蛋白在6%~10%。偶尔会出现溶血现象。无并发症的患者白细胞计数显示正常或轻度升高，有时可见到左移。红细胞沉降率大多增快。
出现镜下血尿和尿蛋白。当并发急性肾小球肾炎、间质性肾炎、肾梗塞时，肉眼可见血尿、脓尿，及血尿素氮和肌酐的升高。肠球菌性心内膜炎常可导致肠球菌菌尿，金葡菌性心内膜炎亦然，因此作尿培养也有助于诊断。
一般无特异性。在并发栓塞性心肌梗塞、心包炎时可显示特征性改变。在伴有室间隔脓肿或瓣环脓肿时可出现不全性或完全性房室传导阻滞，或束支传导阻滞和室性早搏。
仅对心力衰竭、肺梗塞等并发症诊断有帮助，当置换人造瓣膜患者发现瓣膜有异常摇动或移位时，提示可能合并感染性心内膜炎。
可见瓣膜上的赘生物的部位、大小、数目、形态等。对新出现的瓣膜返流，尤其对血培养呈阳性的感染性心内膜炎的诊断比较重要。
