由于系统性红斑狼疮可累及全身各个系统，因此并发症数量繁多，分布广泛。

皮肤与黏膜并发症

皮肤和附属器受累，可引起面部和全身的皮疹，以及永久性的脱发和斑秃，影响容貌；而血管受累，引起血管炎，可影响皮肤供血，导致皮肤、黏膜溃疡和指端缺血坏死。

运动系统并发症

• 系统性红斑狼疮可直接损伤关节的组织，引起多关节的关节炎；
• 引起关节周围肌腱受损，可导致多关节半脱位畸形，但可保持功能的Jaccoud关节病；
• 损伤肌肉组织可引起肌炎；
• 系统性红斑狼疮的活动可引起骨质疏松；
• 系统性红斑狼疮引起的血管炎以及糖皮质激素的副作用还可导致股骨头坏死和骨梗死。

浆膜炎症相关并发症

系统性红斑狼疮侵犯浆膜，引起炎症，可使血浆通过浆膜，进入附近腔隙，引起胸腔积液、心包积液和腹水。

肾脏并发症

系统性红斑狼疮侵犯肾脏，可引起包括肾小球肾炎、肾间质-小管病变、肾血管病变以及梗阻性肾病等多种病变。

其中以蛋白尿、血尿、管型尿、水肿、高血压为主要表现的称为狼疮肾炎，是系统性红斑狼疮主要的脏器损害之一，最终可进展至肾功能衰竭。

另外，系统性红斑狼疮引起泌尿系统平滑肌受损，还可导致膀胱炎、输尿管扩张和肾盂积水。

神经系统并发症

系统性红斑狼疮引起的神经系统损伤称为神经性狼疮，表现因受累部位、程度不同，差异很大，其中重症的中枢神经系统受损称为狼疮脑病。

血液系统并发症

活动性系统性红斑狼疮可引起贫血、白细胞减少、血小板减少，少数血小板减少患者病情凶险。

心血管并发症

• 系统性红斑狼疮累及心包，可引起心包炎，并可出现心包积液，严重者还会引起心包填塞，影响心功能；
• 侵犯心内膜，可引起心内膜炎，心内膜炎可并发感染，或形成瓣膜赘生物和继发血栓，赘生物和血栓脱落可能引起各脏器的血栓栓塞症；
• 侵犯心肌，可引起心肌炎，并可能出现各种心律失常，严重者还会出现心力衰竭；
• 侵犯冠状动脉，可引起心肌梗死。

肺部并发症

• 系统性红斑狼疮累及胸膜，可引起胸腔积液；
• 累及肺，可引起肺间质纤维化；
• 累及肺血管，可引起肺动脉高压；
• 其他较少见的肺部并发症还有肺栓塞、非萎缩综合征、机化性肺炎等。

此外，糖皮质激素和免疫抑制剂治疗会使患者更易患各种肺部感染。

消化系统并发症

• 系统性红斑狼疮侵犯肠道，可引起蛋白丢失性肠病，继而引起顽固的低蛋白血症；
• 侵犯胰脏，可引起胰腺炎；
• 侵犯肠系膜血管，可导致肠出血、麻痹性肠梗阻、肠坏死。

抗磷脂综合征

可继发于系统性红斑狼疮，主要表现为动静脉血栓形成、血小板减少、习惯性流产、心脏瓣膜赘生物等。患者血中可检出高滴度抗磷脂抗体。

个别患者会在短期内在多个重要器官出现血栓栓塞，引起器官功能衰竭，十分凶险，称为“灾难性抗磷脂综合征”。

眼部并发症

• 系统性红斑狼疮累及眼底，可引起眼底出血、视乳头水肿、视网膜渗出和出血；
• 眼部其他受累还可引起结膜炎、葡萄膜炎、视神经病变等；
• 系统性红斑狼疮继发抗磷脂综合征，可引起视网膜中央动脉和（或）静脉闭塞；
• 长期大剂量糖皮质激素治疗还可引起青光眼和白内障。

代谢并发症

长期大剂量糖皮质激素治疗会影响糖脂代谢，引起糖尿病和高脂血症。