牙周组织随病程进展，完整性被破坏，牙周袋内的细菌可以通过破损的上皮组织进入血循环，引发一过性菌血症，细菌及其代谢产物对血管的内皮或平滑肌细胞产生破坏，影响血流的正常流动，从而为动脉粥样硬化等心血管疾病的发生提供条件。
牙周炎可引发的免疫炎症反应，可以通过细胞因子导致胰岛素受体的数目减少，可能发生胰岛素抵抗以及血糖控制不良，增加糖尿病的患病风险。
患牙周炎的孕妇口腔内的致病菌，可以破坏局部的牙周组织进入到全身的血液循环系统，引发程度不等的菌血症，出现宫颈软化、子宫肌收缩率增加、胎膜早破等异常，可能导致早产及低体重儿等不良后果.。
牙菌斑作为牙周炎的始动因子，其产生之初会形成可以增加细菌定植的唾液获得性薄膜，随着牙周炎的进展可以使口腔及口咽部的致病细菌，如金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌，甚至是肠道细菌增多，进一步深入到下呼吸道及肺部时，将可能造成各种类型的肺炎以及呼吸道感染。
