肠梗阻的治疗目标为矫正因肠梗阻所致的全身生理状况紊乱（如水、电解质、酸碱平衡紊乱等）以及解除梗阻。
治疗方法可大体分为手术治疗及非手术治疗两部分，医生会根据患者肠梗阻的原因、性质、部位以及全身情况和病情严重程度等决定具体治疗方案。
医生在对患者进行体格检查后，如怀疑患者有弥漫性腹膜炎，或有其他临床恶化迹象，如发热、白细胞增多、心动过速、代谢性酸中毒和持续疼痛等，会及时行手术探查，以免贻误病情。
在医院内，医生会要求禁食和禁水，并在你手臂上置静脉输液管，以便及时补充水、电解质和营养物质，以及后续可能要注射的药物。
放置一根胃管从鼻孔进入到胃内，以引出积压在消化道内的液体和气体，减轻肠腔膨胀，有利于肠壁血液循环的恢复，减少肠壁水肿。
某些部分梗阻的肠袢（因肠壁肿胀而继发的完全性梗阻）可缓解，某些扭曲不重的肠袢也可得以复位。
同时，该方法还可以减轻腹内压，改善因隔肌抬高而导致的呼吸与循环障碍。
需对可能发生的感染进行防治。
由于个体差异大，用药不存在绝对的最好、最快、最有效，除常用非处方药外，应在医生指导下充分结合个人情况选择最合适的药物。
药物使用主要目的为纠正水、电解质、酸碱平衡紊乱，营养支持以及防治感染，具体包括生理盐水、氯化钾注射液、葡萄糖注射液、氨基酸注射液以及广谱抗生素等。
对于特殊的动力性肠梗阻，还可以使用促进肠道蠕动的药物。
手术治疗整体上可分为开腹手术和腹腔镜手术。其中，腹腔镜手术有助于术后肠功能恢复，减少住院时间，而且可以降低术后肠梗阻发病率，但腹腔镜手术肠损伤的发生率也较高。因此，对于两者的选择，需考虑医生专业、谨慎的判断。
各种类型的绞窄性肠梗阻、肿瘤及先天性肠道畸形引起的肠梗阻，以及非手术治疗无效的患者。
在最短时间内，以最简单的方法解除梗阻或恢复肠腔的通畅。
如粘连松解术，肠切开取除肠石、蛔虫等，肠套叠或肠扭转复位术等。
对肠管因肿瘤、炎症性狭窄，或局部肠袢已经失活坏死，则应作肠切除肠吻合术。
应争取在肠坏死以前解除梗阻，恢复肠管血液循环。
有肠壁已呈紫黑色并已塌陷，或肠壁已失去张力和蠕动能力，对刺激无收缩反应，相应的肠系膜终末小动脉无搏动等表现时，往往提示肠管已无生机。
不过，手术中肠袢生机的判断常有困难，小段肠袢如无法确认定有无血运障碍时，以切除为安全。
当梗阻的部位切除有困难，为解除梗阻，可分离梗阻部远近端肠管作短路吻合，旷置梗阻部。
肠梗阻部位的病变复杂或患者情况很差，不允许行复杂的手术，可用这类术式解除梗阻，即在梗阻近端肠管作肠造口术以减压，解除因肠管高度膨胀而带来的生理紊乱。
主要适用于低位肠梗阻，如急性结肠梗阻，如已有肠坏死或肠肿瘤，可切除坏死或肿瘤肠段，将两断端外置作造口术，以后再行二期手术重建肠道的连续性。
对于一般单纯性机械性肠梗阻，尤其是早期不完全性肠梗阻，可辅以中药治疗，如复方大承气汤、甘遂通结汤。此外，针刺足三里、中脘、大枢、内关、合谷等穴位可作为辅助治疗。
结肠镜下置入自扩张金属支架（SEMS），可一定程度上缓解梗阻，且可作为手术治疗前的过渡，以降低造口率、死亡率，但该方法尚缺乏大规模随机对照试验的证据，需内镜医生根据患者具体梗阻部位、程度及全身情况来确定。
