一般通过触诊看患者是否存在肝脾肿大，视诊查看皮肤有无干燥、粗糙以及鱼鳞样改变，以辅助判断疾病。
葡萄糖脑苷脂酶活性检测、骨髓检查、壳三糖酶活性检测、葡萄糖鞘氨醇水平测定、基因检测等为戈谢病的常见检查，其中葡萄糖脑苷脂酶活性检测是戈谢病诊断的金标准。
该检查主要用于检测葡萄糖脑苷脂酶的活性，不同分型患者的酶活性差异较大，这是戈谢病诊断的金标准。当外周血白细胞或皮肤成纤维细胞的葡糖脑苷脂酶活性降低至正常值的30%以下时，即可确诊戈谢病。
包括骨髓穿刺涂片和骨髓活检。由于骨髓穿刺的部位不一，仅有部分戈谢病患者骨髓检查能发现特征性细胞即"戈谢细胞"，在其他类型的溶酶体贮积症或慢性粒细胞白血病等血液病中可能会出现“类戈谢细胞”，所以该检查存在假阳性及假阴性情况。因此骨髓中发现“戈谢细胞”不能确诊戈谢病，未检出“戈谢细胞”也不能排除戈谢病。
戈谢病患者血浆壳三糖酶活性与正常人相比，显著升高，是目前戈谢病生物标记物中升高最显著的，但由于壳三糖酶基因具有多态性，有少数突变个体壳三糖酶水平降低甚至无法检测到。
另外，壳三糖酶活性也是患者在接受药物治疗后变化最大的一个标志物，对于监测疾病进展和治疗反应具有重要意义。
但该生物标记物检测也存在局限性，部分患者壳三糖酶表达缺失；由于突变基因不同，并非所有戈谢病患者均有这一酶活性的异常，所以壳三糖酶活性正常不能排除戈谢病的可能。
葡萄糖鞘氨醇（Lyso-GL1）是戈谢病重要的生物标志物，葡萄糖鞘氨醇可因戈谢病在体内累积，血清浓度升高，具有较高的敏感性和特异性，因此可作为戈谢病诊断和随访监测的指标。
基因诊断并不能完全代替酶活性测定的生化诊断，但可作为诊断的补充依据并能明确对杂合子的诊断。国外经验显示DBS质谱法较荧光法准确性更高，结合Lyso-GL1水平测定及基因检测，即可确诊戈谢病并分型。如果已通过酶学检测确诊戈谢病，可进行基因分子检测，以预测患慢性神经型戈谢病的风险，以及确定合理的治疗和随访方案。
进行血常规检查可以判断是否有贫血；进行生化检查可有血脂异常，如血胆固醇升高、低密度脂蛋白、载脂蛋白降低；进行X射线检查可以判断有无骨质疏松和骨折表现；肝脾肿大者进行B超检查，可以进一步判断；进行脑电图检查有助于早期发现神经系统受累。
